Beşinci operasyon: Soruşturmada sona yaklaşıldığı düşünüldüğü sırada Türkiye 21 Mart'ta bir şafak baskını haberiyle uyandı. Cumhuriyet Gazetesi imtiyaz sahibi İlhan Selçuk, eski İÜ rektörü Prof. Kemal Alemdaroğlu, İP Genel Başkanı Doğu Perinçek'in de aralarında olduğu 13 kişi gözaltındaydı.
Operasyonlar sabah saat 04.00 sıralarında yapıldığı için eleştiriler yükseldi. İddianamenin hazırlanmamış olmaması da eleştirilen
konulardan biriydi.
Tüm eleştiriler sürerken iddialar ve ifadelere yansıyan bilgiler Ergenekon'un darbe hazırlığında olduğu iddiası yönündeydi. İlhan Selçuk'a yöneltilen soruların sohbet havasında olduğu anlaşılıyordu.
İP lideri Perinçek'e yapılan toplantılar, görüşmeler sorulmuştu. Perinçek'in Ergenekon örgütünün manifestosunu yazdığı öne sürülüyordu.
Soruşturmanın temel dayanaklarından biri olan Tuncay Güney'in 2001 yılında evinde ve işyerinde ele geçirilen belgeler zanlılarda da çıkmıştı.
Buna göre Ergenekon TSK içinde örgütlenmiş bir çeteydi. Amaçları devletin içinde ikinci bir devlet oluşturmak, medya ve finans alanlarında yandaş yaratmaktı. Darbe planlarının içinde AKP'nin kapatılmasını sağlamak da sıralanıyordu.(Fotoğrafta Kemal Alemdaroğlu)
İP lideri Doğu Perinçek'le birlikte beş kişi tutuklandı.